Bootstrapは、デフォルトで、フォントサイズは13px、フォントカラーは黒、というように設定されています。 これを変更するには、設定を変更したBootstrapを利用する必要があります。

手っ取り早い方法は、bootstrapのホームページで、設定を変更した上で再ダウンロードする方法です。こちらのページで、変更したいパラメータの値を修正し、ダウンロードしてください。

例えば、フォントサイズを指定するパラメータは @baseFontSize です。フォントサイズに合わせて @baseLineHeight も変更するべきでしょう。 ナビゲーションバーの背景色や文字色なども変更できます。