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yumで以下のようなエラーが出る場合、メタデータを一度初期化するとよいです。

http://ftp.jaist.ac.jp/pub/Linux/CentOS/5.8/extras/x86_64/repodata/filelists.sqlite.bz2: [Errno -1] Metadata file does not match checksum
Trying other mirror.
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メタデータの初期化は以下のとおり。

$ sudo yum clean metadata
$ sudo yum makecache --disableplugin=fastestmirror

お問い合わせは sweng.tips@gmail.com まで。